RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.69□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 RIPK3Q9Y572 518 aa13.69□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 NFIBO00712 420 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 MEIS2O14770 477 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 MAP2K2P36507 400 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TRAPPC10P48553 1259 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 KRT85P78386 507 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 USP17L6PQ6QN14 398 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 MROH8Q9H579 483 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 THSD7BQ9C0I4 1608 aa13.68□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 PFASO15067 1338 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 AOC2O75106 756 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ERCC3P19447 782 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 NSMFQ6X4W1 530 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ANO3Q9BYT9 981 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TMEM260Q9NX78 707 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CFAP45Q9UL16 551 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.67□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ADAMTS3O15072 1205 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CA12O43570 354 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TLR2O60603 784 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 BAG4O95429 457 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TBCKQ8TEA7 893 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ZIC5Q96T25 663 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CEP131Q9UPN4 1083 aa13.66□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 BMP15O95972 392 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 MAPK4P31152 587 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 VEGFBP49765 207 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 INF2Q27J81 1249 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 Q3C1V9 767 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TTC38Q5R3I4 469 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 NEK8Q86SG6 692 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D5Q92609 795 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 CPA4Q9UI42 421 aa13.65□□□□□ -0.22
LMO3-218ENST00000538020 FAM205CA6NFA0 338 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PEX10O60683 326 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 BCRP11274 1271 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 FCER1AP12319 257 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 HSPA6P17066 643 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SREBF1P36956 1147 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 USP11P51784 963 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 CRHR2Q13324 411 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 KCTD2Q14681 263 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 WDR78Q5VTH9 848 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ANO1Q5XXA6 986 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 C17orf99Q6UX52 265 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 PGBD1Q96JS3 809 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MMP19Q99542 508 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.64□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 STRNO43815 780 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 YEATS4O95619 227 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ATP2B1P20020 1258 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 C1QTNF8P60827 252 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ARHGAP4P98171 946 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 STK38Q15208 465 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 LETM2Q2VYF4 491 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 DNERQ8NFT8 737 aa13.63□□□□□ -0.23
LMO3-218ENST00000538020 SPATA32Q96LK8 384 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms