RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 OPLAHO14841 1288 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB5O15062 677 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 MTA3Q9BTC8 594 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 AMNQ9BXJ7 453 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 SYN1P17600 705 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 HSPA4P34932 840 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 MICU3Q86XE3 530 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRU-211ENST00000531385 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 LIFRP42702 1097 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 RNF180Q86T96 592 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 MORC4Q8TE76 937 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 KCNB2Q92953 911 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 REC8O95072 547 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CFBP00751 764 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TNFAIP2Q03169 654 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 KRT32Q14532 448 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 SMPD1P17405 629 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 KIF5BP33176 963 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 RTP1P59025 263 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 PDE4DQ08499 809 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TMTC2Q8N394 836 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 RGS22Q8NE09 1264 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K14Q99558 947 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 VTA1Q9NP79 307 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 PHF24Q9UPV7 400 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 A0A1W2PQY0 241 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CTAGE5O15320 804 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 EDNRBP24530 442 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 BEX3Q00994 111 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 KCNA10Q16322 511 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 APOA5Q6Q788 366 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TLK2Q86UE8 772 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 HSD17B4P51659 736 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM60Q495X7 471 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 DNERQ8NFT8 737 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CALM1P0DP23 149 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CALM2P0DP24 149 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 CALM3P0DP25 149 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 ACLYP53396 1101 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 GJA9P57773 515 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 FANCBQ8NB91 859 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 RMDN3Q96TC7 470 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRU-211ENST00000531385 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GNASQ5JWF2 1037 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 Q6ZUG5 572 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB43O43298 467 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 ASGR1P07306 291 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 GNAQP50148 359 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 FGD1P98174 961 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 APOBRQ0VD83 1088 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRU-211ENST00000531385 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms