RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 STX8Q9UNK0 236 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 TRANK1O15050 2925 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 CYP2C9P11712 490 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 PPARAQ07869 468 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 TNKSO95271 1327 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 REV3LO60673 3130 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 ERC2O15083 957 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 ACTN1P12814 892 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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NELFE-210ENST00000491139 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.67■■□□□ 1.54
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NELFE-210ENST00000491139 TSPY2A6NKD2 308 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 CA3P07451 260 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 KCNQ1P51787 676 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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NELFE-210ENST00000491139 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 RFXAPO00287 272 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 ICAM1P05362 532 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 MYL3P08590 195 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 CPT1AP50416 773 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 CERS4Q9HA82 394 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 SLC9A7Q96T83 725 aa24.64■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.64■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 MTMR7Q9Y216 660 aa24.64■■□□□ 1.54
NELFE-210ENST00000491139 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 RFC2P35250 354 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
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NELFE-210ENST00000491139 CCDC96Q2M329 555 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 DCTPP1Q9H773 170 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 LCTP09848 1927 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 SCN5AQ14524 2016 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NMT2O60551 498 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 RETREG2Q8NC44 543 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
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NELFE-210ENST00000491139 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 DCAF4Q8WV16 495 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 FSD1Q9BTV5 496 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
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NELFE-210ENST00000491139 KIF28PB7ZC32 967 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 PITPNM1O00562 1244 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 INCENPQ9NQS7 918 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 EPOPA6NHQ4 379 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NFIBO00712 420 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 KPNA6O60684 536 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 IQCF3P0C7M6 154 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 SLC16A2P36021 539 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 TAP1Q03518 808 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 CALML3P27482 149 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 BFSP2Q13515 415 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 PPP2R5BQ15173 497 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 KRT40Q6A162 431 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NOD1Q9Y239 953 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-210ENST00000491139 NOVP48745 357 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 PDE4DQ08499 809 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 HLA-CQ95604 372 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 EPHX3Q9H6B9 360 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 BRWD1Q9NSI6 2320 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 TET1Q8NFU7 2136 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 A6NJR5 290 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 TLL1O43897 1013 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-210ENST00000491139 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.56■■□□□ 1.52
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