RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488117.5

C9orf72-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 72, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf72, Length 4,808 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72-205ENST00000488117 CALUO43852 315 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 RHOBTB3O94955 611 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF18P17022 549 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 KRT9P35527 623 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ICA1Q05084 483 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 AP3B2Q13367 1082 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PDIA5Q14554 519 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 HSP90B2PQ58FF3 399 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 SLFN13Q68D06 897 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 STYK1Q6J9G0 422 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 MB21D1Q8N884 522 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 OR8K1Q8NGG5 319 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 NKX2-3Q8TAU0 364 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 EHD4Q9H223 541 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PI4KBQ9UBF8 816 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 POLLQ9UGP5 575 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ECM29Q5VYK3 1845 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 A0A1B0GUL6 1792 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 A0A1W2PQC6 194 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 LGALS16A8MUM7 142 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PRCPP42785 496 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 GOLGA8FQ08AF8 430 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 E2F4Q16254 413 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ABCB5Q2M3G0 1257 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC181Q5TID7 509 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CDKAL1Q5VV42 579 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 RCSD1Q6JBY9 416 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 UNC13DQ70J99 1090 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 MYOCDQ8IZQ8 938 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ADSSL1Q8N142 457 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 OGFOD1Q8N543 542 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 SPATA20Q8TB22 786 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 RAD54LQ92698 747 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 JAKMIP2Q96AA8 810 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 DLEC1Q9Y238 1755 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PLIN4Q96Q06 1357 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 HAX1O00165 279 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ECE2O60344 883 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TACC1O75410 805 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PDHBP11177 359 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 AKR1B1P15121 316 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 HSPA1LP34931 641 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 LRRC63Q05C16 580 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF543Q08ER8 600 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 USP49Q70CQ1 688 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 FBXO11Q86XK2 927 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ADGRF4Q8IZF3 695 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ZNF384Q8TF68 577 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 COA7Q96BR5 231 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC42Q96M95 316 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CARD6Q9BX69 1037 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 AMNQ9BXJ7 453 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 HAUS4Q9H6D7 363 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PANK4Q9NVE7 773 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 GDAQ9Y2T3 454 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 V9GYY5 206 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CACNA1SQ13698 1873 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 SOWAHDA6NJG2 315 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 ATP8B1O43520 1251 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 RPL13P26373 211 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CASP1P29466 404 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CHMP4BP1P59074 171 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 TCP10Q12799 353 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 KIF5AQ12840 1032 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 VWA3BQ502W6 1294 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC122Q5T0U0 273 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 STRIP1Q5VSL9 837 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 PTF1AQ7RTS3 328 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 DYMQ7RTS9 669 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 VPS36Q86VN1 386 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 FMNL3Q8IVF7 1028 aa2.95□□□□□ -1.94
C9orf72-205ENST00000488117 CCDC170Q8IYT3 715 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms