RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 VCPKMTQ9H867 229 aa21.54■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 BMP6P22004 513 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 CEP135Q66GS9 1140 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ISM2Q6H9L7 571 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 GPC2Q8N158 579 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 DHX58Q96C10 678 aa21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 A0A087X0B3 334 aa21.52■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 OR52Z1P0C646 297 aa21.52■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 STAT2P52630 851 aa21.52■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.52■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.52■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.52■■□□□ 1.04
SYF2-204ENST00000476231 CCP110O43303 1012 aa21.52■■□□□ 1.04
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SYF2-204ENST00000476231 FOXN1O15353 648 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 PLA2G6O60733 806 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 ATP1A3P13637 1013 aa21.51■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 UBE2SQ16763 222 aa21.51■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.51■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 IQUBQ8NA54 791 aa21.51■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 FANCLQ9NW38 375 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 ZNF18P17022 549 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 E2F4Q16254 413 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.5■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD7Q92527 254 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 HOOK2Q96ED9 719 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 AK8Q96MA6 479 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 TMX1Q9H3N1 280 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 SBF1O95248 1867 aa21.49■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 FAM160B2Q86V87 743 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 PAGE5Q96GU1 130 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 GSDMAQ96QA5 445 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 FEM1BQ9UK73 627 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 EDIL3O43854 480 aa21.47■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.47■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.47■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 USP17L11C9JVI0 530 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 USP17L18D6R9N7 530 aa21.46■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 USP17L19D6RCP7 530 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 USP17L20D6RJB6 530 aa21.46■■□□□ 1.03
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SYF2-204ENST00000476231 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 DISC1Q9NRI5 854 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-204ENST00000476231 TDP2O95551 362 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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SYF2-204ENST00000476231 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 AFMP43652 599 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-204ENST00000476231 USP11P51784 963 aa21.45■■□□□ 1.02
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