RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BCL9	O00512	1426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TAF5L	O75529	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PCK1	P35558	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MSH2	P43246	934 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	VAV2	P52735	878 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TMED1	Q13445	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ITIH4	Q14624	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PLS1	Q14651	629 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	INF2	Q27J81	1249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ABCC1	P33527	1531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	WFS1	O76024	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TMCC1	O94876	653 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	UBOX5	O94941	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GNA14	O95837	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	IDE	P14735	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ACADS	P16219	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PEX5	P50542	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	4e-6	■■□□□ 11.7
RBMS1-208	ENST00000474147	KRT32	Q14532	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	OTUD5	Q96G74	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	3e-10	■■■■□ 19.3
RBMS1-208	ENST00000474147	NACA2	Q9H009	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ASAP2	O43150	1006 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	VCAM1	P19320	739 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PLCD1	P51178	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	OXCT1	P55809	520 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MCL1	Q07820	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	PTPA	Q15257	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	TRADD	Q15628	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	MCM10	Q7L590	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBMS1-208	ENST00000474147	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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