RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.8	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBED4	O75132	1171 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM4A	O75164	1064 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	CDK7	P50613	346 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	PTH1R	Q03431	593 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.79	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	MYH6	P13533	1939 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	NMT2	O60551	498 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	PFKM	P08237	780 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP2C18	P33260	490 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC1A4	P43007	532 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	GJA9	P57773	515 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	TRDN	Q13061	729 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	MAF1	Q9H063	256 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	COG5	Q9UP83	839 aa		11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	TRANK1	O15050	2925 aa		11.77	□□□□□ -0.52
TTLL3-223	ENST00000466245	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245		B4E1Z4	1266 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245		E7EWF7	191 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	PDHB	P11177	359 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ACTN1	P12814	892 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.77	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	BMP1	P13497	986 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MCC	P23508	829 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SEC23A	Q15436	765 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF536	O15090	1300 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TNKS	O95271	1327 aa		11.76	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ASB14	A6NK59	587 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CD4	P01730	458 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TNFAIP2	Q03169	654 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGA7	Q13683	1181 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	REV3L	O60673	3130 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC27A2	O14975	620 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNQ1	P51787	676 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	CCL23	P55773	120 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-223	ENST00000466245	TFF2	Q03403	129 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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