RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 GPC2Q8N158 579 aa8.54□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 RMND1Q9NWS8 449 aa8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.54□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 CEP112Q8N8E3 955 aa8.54□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 SPATA24Q86W54 205 aa8.53□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.53□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 NOD1Q9Y239 953 aa8.53□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ESYT2A0FGR8 921 aa8.53□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.53□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 SHC4Q6S5L8 630 aa8.53□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.53□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.53□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.53□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 COA7Q96BR5 231 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CEP95Q96GE4 821 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 WRNIP1Q96S55 665 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 AZI2Q9H6S1 392 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.52□□□□□ -1.05
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USP54-210ENST00000466048 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.52□□□□□ -1.05
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USP54-210ENST00000466048 POLR2MP0CAP2 368 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 EPHX2P34913 555 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 CPXCR1Q8N123 301 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 AK8Q96MA6 479 aa8.52□□□□□ -1.05
USP54-210ENST00000466048 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.52□□□□□ -1.05
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