RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465125.1

RERE-208, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 5

Gene RERE, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-208ENST00000465125 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.11■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.11■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 POTEB2H3BUK9 544 aa28.1■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 PGK2P07205 417 aa28.1■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 CALML3P27482 149 aa28.1■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 MAP2K5Q13163 448 aa28.1■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 TRIM29Q14134 588 aa28.1■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 TBC1D5Q92609 795 aa28.1■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 C6orf50Q9HD87 102 aa28.1■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.1■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 SHISA4Q96DD7 197 aa28.09■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.09■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.09■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.08■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa28.08■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 PRMT2P55345 433 aa28.08■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.08■■■□□ 2.09
RERE-208ENST00000465125 USP6NLQ92738 828 aa28.08■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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RERE-208ENST00000465125 COBLO75128 1261 aa28.07■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 FLT3LGP49771 235 aa28.07■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 C8orf76Q96K31 380 aa28.07■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.07■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 UBE2SQ16763 222 aa28.06■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.06■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 FAM133AQ8N9E0 248 aa28.06■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.05■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 KRT40Q6A162 431 aa28.04■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 RAET1EQ8TD07 263 aa28.04■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 COL20A1Q9P218 1284 aa28.04■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.03■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.03■■■□□ 2.08
RERE-208ENST00000465125 SOWAHBA6NEL2 793 aa28.02■■■□□ 2.08
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RERE-208ENST00000465125 MCTP2Q6DN12 878 aa28.01■■■□□ 2.07
RERE-208ENST00000465125 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RERE-208ENST00000465125 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.01■■■□□ 2.07
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RERE-208ENST00000465125 RMDN3Q96TC7 470 aa28.01■■■□□ 2.07
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RERE-208ENST00000465125 PDCP20941 246 aa28■■■□□ 2.07
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RERE-208ENST00000465125 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RERE-208ENST00000465125 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
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