RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 ZEB2O60315 1214 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 CALML3P27482 149 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 WTAPQ15007 396 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.3■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 KIAA0355O15063 1070 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 CLTBP09497 229 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 SMPD1P17405 629 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 CDK7P50613 346 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 GHRHRQ02643 423 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 TROAPQ12815 778 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 TLK2Q86UE8 772 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 TMTC2Q8N394 836 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 AMNQ9BXJ7 453 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 CPVLQ9H3G5 476 aa24.29■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 MYADML2A6NDP7 307 aa24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 GRM4Q14833 912 aa24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 USH1GQ495M9 461 aa24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.28■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB5O15062 677 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 PDE4DQ08499 809 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 NECTIN1Q15223 517 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 IWS1Q96ST2 819 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.27■■□□□ 1.48
SIKE1-204ENST00000462123 ARVCFO00192 962 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SCFD2Q8WU76 684 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM87BQ96K49 555 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.25■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SMARCA1P28370 1054 aa24.25■■□□□ 1.47
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SIKE1-204ENST00000462123 ANTXR2P58335 489 aa24.25■■□□□ 1.47
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SIKE1-204ENST00000462123 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.25■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.24■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.24■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SLC27A2O14975 620 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 DDAH1O94760 285 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 LIFRP42702 1097 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 HSD17B4P51659 736 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 RNF20Q5VTR2 975 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.23■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 KPNA6O60684 536 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 RAG1P15918 1043 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 KIF5BP33176 963 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 CPT1AP50416 773 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 BEX3Q00994 111 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 BADQ92934 168 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 RMDN3Q96TC7 470 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 LY9Q9HBG7 655 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 GNAQP50148 359 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TTLL4Q14679 1199 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 PPP2R5BQ15173 497 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 STXBP2Q15833 593 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TBC1D5Q92609 795 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.21■■□□□ 1.47
SIKE1-204ENST00000462123 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.21■■□□□ 1.47
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