RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457647.2

RGPD4-AS1-202, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGPD4-AS1, Length 1,792 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BTBD18B2RXH4 712 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KIF28PB7ZC32 967 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 M0R2N6 131 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PGK2P07205 417 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 XBP1P17861 261 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CALML3P27482 149 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 HSD17B4P51659 736 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CNTN2Q02246 1040 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SP3Q02447 781 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TRAF1Q13077 416 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TRIM29Q14134 588 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BLIDQ8IZY5 108 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 JMYQ8N9B5 988 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TRIM47Q96LD4 638 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MMP19Q99542 508 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 C6orf50Q9HD87 102 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MTMR6Q9Y217 621 aa14.5□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FAM205CA6NFA0 338 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 H3BQV1 296 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 STX6O43752 255 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 POLR2MP0CAP2 368 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MAPK4P31152 587 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PSMC4P43686 418 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IFFO2Q5TF58 517 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FBXO40Q9UH90 709 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ASTN1O14525 1302 aa14.49□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FCER1AP12319 257 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PDCP20941 246 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PTPREP23469 700 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ADORA2AP29274 412 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 COPB2P35606 906 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GHRHRQ02643 423 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FERMT3Q86UX7 667 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TNFRSF25Q93038 417 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.48□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PIK3CDO00329 1044 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 COBLO75128 1261 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GNA11P29992 359 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KRT2P35908 639 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GRB14Q14449 540 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MCTP1Q6DN14 999 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 RGS22Q8NE09 1264 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FGD4Q96M96 766 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TCHHQ07283 1943 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FOXN1O15353 648 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 UBXN2AP68543 259 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KCTD2Q14681 263 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 MORN1Q5T089 497 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GJD2Q9UKL4 321 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.47□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 BRCA2P51587 3418 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PFASO15067 1338 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FKTNO75072 461 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GALNT17Q6IS24 598 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FAM133AQ8N9E0 248 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 IL31RAQ8NI17 732 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 GABRQQ9UN88 632 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.46□□□□□ -0.09
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.46□□□□□ -0.1
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.45□□□□□ -0.1
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 POTEB2H3BUK9 544 aa14.45□□□□□ -0.1
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 EDIL3O43854 480 aa14.45□□□□□ -0.1
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 FCGRTP55899 365 aa14.45□□□□□ -0.1
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
RGPD4-AS1-202ENST00000457647 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms