RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 COPS5Q92905 334 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 RFXAPO00287 272 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 N4BP3O15049 544 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 GJB6O95452 261 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 ITGAVP06756 1048 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 DBHP09172 617 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 PLS3P13797 630 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 C1QL4Q86Z23 238 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 LZTR1Q8N653 840 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 MZB1Q8WU39 189 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 LGR4Q9BXB1 951 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 EPN3Q9H201 632 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 CLEC1BQ9P126 229 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 IRAK3Q9Y616 596 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 NACADO15069 1562 aa6.09□□□□□ -1.43
RBM39-210ENST00000425184 NPHS1O60500 1241 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 CDR1P51861 262 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 EPHB3P54753 998 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ZNF385BQ569K4 471 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 KCTD3Q9Y597 815 aa6.08□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 C7orf72A4D263 438 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 AGRPO00253 132 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 THBDP07204 575 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 HOXC12P31275 282 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 LDHDQ86WU2 507 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 USP33Q8TEY7 942 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 MMP19Q99542 508 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ST7Q9NRC1 585 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 GULP1Q9UBP9 304 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 F8W031 263 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 TBX1O43435 398 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 KLF4O43474 513 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 GLI4P10075 376 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 SSPNQ14714 243 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 DDR2Q16832 855 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 IQCEQ6IPM2 695 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 CCDC140Q96MF4 163 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 MTA3Q9BTC8 594 aa6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 PI3P19957 117 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 PRR5P85299 388 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 FRS2Q8WU20 508 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 CPP00450 1065 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 FUCA1P04066 466 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 SCG5P05408 212 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 PFKLP17858 780 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 ECI1P42126 302 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 KCNJ6P48051 423 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 NCKAP1LP55160 1127 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 CYP4F3Q08477 520 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 MBLAC2Q68D91 279 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 NETO2Q8NC67 525 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 PEX11GQ96HA9 241 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.04□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-210ENST00000425184 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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