RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 IQCEQ6IPM2 695 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TTI2Q6NXR4 508 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP3Q96P20 1036 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NYXQ9GZU5 481 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 IDEP14735 1019 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRK1P26718 216 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 DNM2P50570 870 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP27A1Q02318 531 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 HINFPQ9BQA5 517 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIN2DO15399 1336 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SRGNP10124 158 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CALML3P27482 149 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNB1Q14721 858 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 GBP6Q6ZN66 633 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 JADE2Q9NQC1 790 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOC1Q9NV70 894 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RGL2O15211 777 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOBTB3O94955 611 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 UBA7P41226 1012 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 GNGT1P63211 74 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3GL2Q99962 352 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.41■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MECOMQ03112 1051 aa20.4■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 INF2Q27J81 1249 aa20.4■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.4■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.4■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 NFIXQ14938 502 aa20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP89Q96ST8 783 aa20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.39■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SHTN1A0MZ66 631 aa20.39■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF5BP33176 963 aa20.39■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE4AQ14139 1066 aa20.39■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.39■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM37O94972 964 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TM4SF1P30408 202 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CREG2Q8IUH2 290 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 M0R2N6 131 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 RUBCNQ92622 972 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX12Q9UMY4 172 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR7Q9Y216 660 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.38■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 OPA1O60313 960 aa20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDX5P30044 214 aa20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBED6P86452 979 aa20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF263O14978 683 aa20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 JAG2Q9Y219 1238 aa20.37■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.36■□□□□ 0.85
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCG1P19174 1290 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms