RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 RNF146Q9NTX7 359 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.34□□□□□ -0.59
CD27-AS1-202ENST00000417058 NFIBO00712 420 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CA12O43570 354 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 TLR2O60603 784 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLC25A27O95847 323 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ALDH1A1P00352 501 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 COPB2P35606 906 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 BRAPQ7Z569 592 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CHST13Q8NET6 341 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 BCRP11274 1271 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 HSD17B4P51659 736 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 UBE2SQ16763 222 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 TBC1D5Q92609 795 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ACAD9Q9H845 621 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FBXO40Q9UH90 709 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CFBP00751 764 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 POLR2MP0CAP2 368 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ERCC3P19447 782 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCNA1P78396 465 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CRHR2Q13324 411 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 AP3B2Q13367 1082 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MCTP2Q6DN12 878 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 C17orf99Q6UX52 265 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 TMEM260Q9NX78 707 aa11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FAM205CA6NFA0 338 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 PORCNQ9H237 461 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MROH8Q9H579 483 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CPA4Q9UI42 421 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.31□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 NSMFQ6X4W1 530 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 EFCC1Q9HA90 598 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 COL20A1Q9P218 1284 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 PFASO15067 1338 aa11.3□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 EDIL3O43854 480 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 TRAPPC10P48553 1259 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 PGBD1Q96JS3 809 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ANO3Q9BYT9 981 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 RNF186Q9NXI6 227 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.29□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 STRNO43815 780 aa11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 MAPK4P31152 587 aa11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 SREBF1P36956 1147 aa11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 INF2Q27J81 1249 aa11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 ATL3Q6DD88 541 aa11.28□□□□□ -0.6
CD27-AS1-202ENST00000417058 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms