RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 MUM1L1Q5H9M0 696 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 OSBP2Q969R2 916 aa21.85■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF15O94989 841 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 GNAT2P19087 354 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 CPT1AP50416 773 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 GRB10Q13322 594 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 APPBP2Q92624 585 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 GMCL1Q96IK5 515 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 SCN5AQ14524 2016 aa21.84■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 GPAA1O43292 621 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 GPR37L1O60883 481 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 MS4A1P11836 297 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 TFAP4Q01664 338 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 PDE4BQ07343 736 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 KCTD1Q719H9 257 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2C-204ENST00000356455 TRANK1O15050 2925 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 IQCF3P0C7M6 154 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 NOD1Q9Y239 953 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 KCNJ6P48051 423 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 MORC4Q8TE76 937 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 MTMR7Q9Y216 660 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PITPNM1O00562 1244 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 CHMP4BP1P59074 171 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 BFSP2Q13515 415 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 C11orf16Q9NQ32 467 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 STX8Q9UNK0 236 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 RAD50Q92878 1312 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 M0R2C6 588 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PLA2G6O60733 806 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 SPRED2Q7Z698 418 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 BAIAP3O94812 1187 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 KPNA6O60684 536 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 LPXNO60711 386 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ICAM1P05362 532 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 PPP2R5BQ15173 497 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC96Q2M329 555 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 GPATCH3Q96I76 525 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 NAPBQ9H115 298 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2C-204ENST00000356455 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 LCHNA4D1U4 455 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 PPARAQ07869 468 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 PDE4DQ08499 809 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 CD320Q9NPF0 282 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.76■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 LCTP09848 1927 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 TSPY2A6NKD2 308 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 CALML3P27482 149 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.75■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.74■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 NFIBO00712 420 aa21.74■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
UBE2C-204ENST00000356455 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms