RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SMCHD1A6NHR9 2005 aa12.76□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 OPLAHO14841 1288 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 PRCPP42785 496 aa12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 ATP2B2Q01814 1243 aa12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 CALCRLQ16602 461 aa12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 UBE2SQ16763 222 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 IRF2BP1Q8IU81 584 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa12.75□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa12.75□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 TMEM119Q4V9L6 283 aa12.74□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 MCTP2Q6DN12 878 aa12.74□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.74□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 GDAQ9Y2T3 454 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 SYDE2Q5VT97 1194 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.74□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 AMNQ9BXJ7 453 aa12.74□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 USP17L11C9JVI0 530 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 USP17L18D6R9N7 530 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 USP17L22D6RA61 530 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 USP17L19D6RCP7 530 aa12.73□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 PIK3CDO00329 1044 aa12.73□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 CCDC125Q86Z20 511 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 OGFOD1Q8N543 542 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 ACER1Q8TDN7 264 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 NELFBQ8WX92 580 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 LRWD1Q9UFC0 647 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.73□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 H7C1D1 291 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 NFKBIEO00221 500 aa12.72□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 TNNI2P48788 182 aa12.72□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 ECM1Q16610 540 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 TTI2Q6NXR4 508 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 NIM1KQ8IY84 436 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 LENG9Q96B70 501 aa12.72□□□□□ -0.37
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PGA3-201ENST00000325558 ANO3Q9BYT9 981 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 ITIH6Q6UXX5 1313 aa12.72□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 MYMKA6NI61 221 aa12.71□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 PHF20L1A8MW92 1017 aa12.71□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 CYP3A4P08684 503 aa12.71□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.71□□□□□ -0.37
PGA3-201ENST00000325558 Q4G0T1 1027 aa12.71□□□□□ -0.37
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