RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDE4DQ08499 809 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 SUSD4Q5VX71 490 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.8■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM153BP0C7A2 387 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM153CQ494X1 144 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNE1P24864 410 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 INF2Q27J81 1249 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO1FO00160 1098 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZPR1O75312 459 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNA2P51530 1060 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP2B2Q01814 1243 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 NNTQ13423 1086 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.79■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 BUB1O43683 1085 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CARSP49589 748 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 SKOR1P84550 965 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 APBA1Q02410 837 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPARDQ03181 441 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHRNDQ07001 517 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 EMBQ6PCB8 327 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF384Q8TF68 577 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLI1P08151 1106 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 GUCY1A3Q02108 690 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 C8orf74Q6P047 294 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP89Q96ST8 783 aa24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLIT2O94813 1529 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKR1B10O60218 316 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCG1P19174 1290 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK17Q00537 523 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITIH3Q06033 890 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALS2CLQ60I27 953 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFU1Q9UMS0 254 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP2D6P10635 497 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFT81Q8WYA0 676 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 TLR10Q9BXR5 811 aa24.77■■□□□ 1.56
GRAMD1A-201ENST00000317991 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRLRP16471 622 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR8Q96EF0 704 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP98P52948 1817 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF233A6NK53 670 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGRP09769 529 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASIC1P78348 528 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMC4Q7Z404 712 aa24.76■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1W2PQJ5 194 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEDQ86YR6 584 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAVIN3Q969G5 261 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM9Q9C026 710 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR7Q9Y216 660 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEA1P43355 309 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 GUCY2FP51841 1108 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASSF7Q02833 373 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRADDQ15628 312 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 RRAGAQ7L523 313 aa24.75■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRP5O75197 1615 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC53A6NM62 1247 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAFAH1B1P43034 410 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FIGNQ5HY92 759 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 BICDL2A1A5D9 508 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALML3P27482 149 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FNTAP49354 379 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TXNRD1Q16881 649 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNPY4Q8N129 248 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 OTUD6BQ8N6M0 293 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms