RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 STK38Q15208 465 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 NAPBQ9H115 298 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SENP2Q9HC62 589 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R37O75864 691 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 LAMB3Q13751 1172 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ARMC3Q5W041 872 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V1G2O95670 118 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CYP7A1P22680 504 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ARL8AQ96BM9 186 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 FERP16591 822 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ZNF18P17022 549 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 VPS37DQ86XT2 251 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ZNF384Q8TF68 577 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 RUBCNQ92622 972 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CUL5Q93034 780 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 NOD2Q9HC29 1040 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 RGL1Q9NZL6 768 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ZMYM6O95789 1325 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CDKL5O76039 1030 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CMA1P23946 247 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SPATA21Q7Z572 469 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 NUP58Q9BVL2 599 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 DNM1LO00429 736 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SPECC1Q5M775 1068 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 MMS19Q96T76 1030 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 YIPF3Q9GZM5 350 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CACNA1SQ13698 1873 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 PFKFB1P16118 471 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 FECHP22830 423 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 MYO1EQ12965 1108 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 RUFY1Q96T51 708 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SPTLC2O15270 562 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 GUCY1B3Q02153 619 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 NR1I3Q14994 352 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ZMYND10O75800 440 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 P3H4Q92791 437 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CHD4Q14839 1912 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 SMIM22K7EJ46 135 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 ATP1A2P50993 1020 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 HHATQ5VTY9 493 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 RXRAP19793 462 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 SCTRP47872 440 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.26■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 A6NHS1 94 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 OPLAHO14841 1288 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 HSF2BPO75031 334 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 CCDC51Q96ER9 411 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 PSMD14O00487 310 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 LINGO3P0C6S8 592 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 GNAT2P19087 354 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 BLMHQ13867 455 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 ZFAND2BQ8WV99 257 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX1-201ENST00000265340 CLIC4Q9Y696 253 aa24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms