RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm6121L7MUF1 212 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stag2O35638 1231 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mdh1P14152 334 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ckap2Q3V1H1 664 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tsr1Q5SWD9 803 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem132dQ76HP3 1097 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rsad2Q8CBB9 362 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 BaatQ91X34 420 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmco5aQ9D9D5 303 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CoasyQ9DBL7 563 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Wdr19Q3UGF1 1341 aa15.23■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ankrd63A2ARS0 390 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rad51bO35719 350 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pik3caP42337 1068 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ric8aQ3TIR3 530 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Haus4Q8BFT2 363 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem132aQ922P8 1018 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arl6ip4Q9JM93 229 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Surf1P09925 306 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 BbxQ8VBW5 907 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pagr1bF6V0H0 108 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt19P19001 403 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mettl14Q3UIK4 456 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppp1r7Q3UM45 361 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Drc1Q3USS3 753 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Srgap2Q91Z67 1071 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pagr1aQ99L02 253 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Myo1hQ9D6A1 958 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ubxn8Q9QZ49 277 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa15.22■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm7356A0A087WSA6 508 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Capn2O08529 700 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Spa17Q62252 149 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem63cQ8CBX0 802 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Q91WD4 421 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krtap5-3Q9D226 196 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sgpp1Q9JI99 430 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tex21Q9R0U9 575 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nwd1A6H603 1563 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mroh8E9PYI4 1049 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zfp408H7BX78 710 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Traf1P39428 409 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gfpt1P47856 697 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stxbp3Q60770 592 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ints8Q80V86 995 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SncbQ91ZZ3 133 aa15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Xrcc6P23475 608 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cacnb3P54285 484 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gjb4Q02738 266 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rnf40Q3U319 1001 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 AsphQ8BSY0 741 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atp6v0a4Q920R6 833 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tgs1Q923W1 853 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Etnk1Q9D4V0 363 aa15.21■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt8P11679 490 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccna1Q61456 421 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cnnm4Q69ZF7 771 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt74Q6IFZ9 495 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm13023A2A8N2 498 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 MeiocA2AG06 965 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gbp1Q01514 589 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Llgl2Q3TJ91 1027 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Carmil2Q3V3V9 1296 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stoml1Q8CI66 399 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Acot11Q8VHQ9 594 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Speer2E9Q9U2 264 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gad1P48318 593 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 HarsQ61035 509 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pim2Q62070 370 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Erp44Q9D1Q6 406 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 IqcdQ9D3V1 458 aa15.2■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm7168A0AUV4 508 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pgrmc1O55022 195 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 FosP01101 380 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam89aQ14BJ1 175 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arhgef16Q3U5C8 713 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc39a11Q8BWY7 342 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Strip1Q8C079 837 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Q8C6G1 249 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem134Q8R0J4 195 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cplx3Q8R1B5 158 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 EgfrQ01279 1210 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem109Q3UBX0 243 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ctnna3Q65CL1 895 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Creld2Q9CYA0 350 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa15.19■□□□□ 0.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LdhbP16125 334 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms