RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	SNL1	P40548	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MPS3	P47069	682 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YJR154W	P47181	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GNP1	P48813	663 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MET13	P53128	600 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SPC105	P53148	917 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CLD1	P53264	445 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COQ6	P53318	479 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SWP1	Q02795	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GAS3	Q03655	524 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HSP31	Q04432	237 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SGT1	Q08446	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	UAF30	Q08747	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ICT1	Q12385	394 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PRC1	P00729	532 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MSS18	P08593	268 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CCA1	P21269	546 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PDE1	P22434	369 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RBK1	P25332	333 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FRE2	P36033	711 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	LDB7	P38210	180 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FTH1	P38310	465 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YBR242W	P38331	238 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CYC2	P38909	366 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ALG8	P40351	577 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SIP4	P46954	829 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DIA3	P52290	468 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YGR053C	P53234	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IPI3	P53877	555 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TFB3	Q03290	321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GOT1	Q03554	138 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RCO1	Q04779	684 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GMC2	Q06201	188 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MUM3	Q08750	479 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SOG2	Q08817	791 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RSA1	Q08932	381 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PDE2	P06776	526 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PUT2	P07275	575 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COS2	P0CX12	379 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COS3	P0CX13	379 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COX13	P32799	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RPC34	P32910	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IST2	P38250	946 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	EFM1	P38732	585 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YHR045W	P38775	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YIR007W	P40566	764 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	IMA5	P40884	581 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COS4	P43542	379 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DIE2	P50076	525 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	AMA1	P50082	593 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	NAS6	P50086	228 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	COG1	P53079	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SHY1	P53266	389 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	GPI1	P53306	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DML1	Q03652	475 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	REH1	Q06709	432 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ATG29	Q12092	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PEX11	Q12462	236 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	SNF4	P12904	322 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PHO81	P17442	1178 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CLB3	P24870	427 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	CAF4	P36130	643 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ARP1	P38696	384 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	DSS1	P39112	969 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	MEP1	P40260	492 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YIR016W	P40572	265 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	FKH2	P41813	862 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	YNL143C	P53908	130 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	PNG1	Q02890	363 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	RIF2	Q06208	395 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	BSP1	Q06604	576 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KAR2	YJL034W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66

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