RNA–Protein interactions for RNA: YHR133C

NSG1, Transcript of Protein involved in regulation of sterol biosynthesis, yeast

Gene NSG1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSG1	YHR133C	MET8	P15807	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CLB1	P24868	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RSC6	P25632	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RML2	P32611	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CAB3	P36076	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RIM11	P38615	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RFC3	P38629	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	HXT5	P38695	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GIC1	P38785	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ERP5	P38819	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	FRT2	P39734	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	NBP35	P52920	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MPS2	P53159	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SHY1	P53266	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ZRG17	P53735	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	FMN1	Q03778	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	BCH1	Q05029	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TRM8	Q12009	286 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	VPS68	Q12016	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ATG34	Q12292	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	NHA1	Q99271	985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CDC21	P06785	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SPT3	P06844	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	VPS34	P22543	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ARG1	P22768	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YSR3	P23501	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ATP11	P32453	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	UBA4	P38820	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YEL073C	P39974	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YEN1	P40028	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	EMP65	P40085	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YJL070C	P40361	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	NUP85	P46673	744 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	BIR1	P47134	954 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TIS11	P47977	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	COQ5	P49017	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SNO2	P53823	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GTR1	Q00582	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YML131W	Q03102	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GAS3	Q03655	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RIF2	Q06208	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
NSG1	YHR133C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	STT4	P37297	1900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	COX3	P00420	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TRP3	P00937	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	STE3	P06783	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	COX13	P32799	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SDH3	P33421	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	TSC10	P38342	320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GIP4	P39732	760 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MET18	P40469	1032 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	MDM34	P53083	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YGR015C	P53208	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	NNF2	P53253	936 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ATF2	P53296	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YML053C	Q04978	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	RAD34	Q06665	692 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	PLB3	Q08108	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	ESA1	Q08649	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	GPB1	Q08886	897 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	PST1	Q12355	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NSG1	YHR133C	AI3	P03877	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSG1	YHR133C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NSG1	YHR133C	COS2	P0CX12	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NSG1	YHR133C	COS3	P0CX13	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.8 ms