RNA–Protein interactions for RNA: YHR101C

BIG1, Transcript of Integral membrane protein of the endoplasmic reticulum, yeast

Gene BIG1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BIG1	YHR101C	IMG1	P25626	169 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	PCA1	P38360	1216 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YTA12	P40341	825 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	LYS14	P40971	790 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	PTR3	P43606	678 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	BSC5	P53755	489 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YML037C	Q03703	340 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	GLO2	Q05584	274 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	AYT1	Q12226	474 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	SKM1	Q12469	655 aa		2.61	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	SGS1	P35187	1447 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	HEM2	P05373	342 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	POL4	P25615	582 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	SPC110	P32380	944 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	COS10	P52924	374 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	SHR3	Q02774	210 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	SMA2	Q04658	369 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YDL057W	Q07379	328 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YLL056C	Q12177	298 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	SPE4	Q12455	300 aa		2.6	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	CBS2	P14905	389 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	PRE8	P23639	250 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	BOS1	P25385	244 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YCR022C	P25620	114 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	FRE1	P32791	686 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	UBP11	P36026	717 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	ICS2	P38284	255 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	AFG3	P39925	761 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	CSM2	P40465	213 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	DSD1	P53095	428 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	MEP3	P53390	489 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	BOR1	P53838	576 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	YPL272C	Q08984	517 aa		2.59	□□□□□ -1.99
BIG1	YHR101C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	PEP5	P12868	1029 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	RER1	P25560	188 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
BIG1	YHR101C	FAR3	P46671	204 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YGR126W	P53274	230 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YGR127W	P53275	312 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	WSC2	P53832	503 aa		2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
BIG1	YHR101C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	MRP13	P12686	339 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YCK1	P23291	538 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YIH1	P25637	258 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	CHS3	P29465	1165 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YEL068C	P39977	110 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	SPG5	P42933	373 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	RTS3	P53289	263 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	NGL3	Q03210	505 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	SYO1	Q07395	620 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	SDH5	Q08230	162 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YDL009C	Q12210	107 aa		2.57	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	REV1	P12689	985 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YBR144C	P34215	104 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	PMU1	P36069	295 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	NPR2	P39923	615 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YJR154W	P47181	346 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	ALT2	P52892	507 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	SLD5	Q03406	294 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YMR018W	Q04364	514 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YKU80	Q04437	629 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	COQ9	Q05779	260 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	BNA5	Q05979	453 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YOR365C	Q08844	703 aa		2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	CDC16	P09798	840 aa		2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	TUL1	P36096	758 aa		2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YBL029W	P38201	376 aa		2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	YHR210C	P38893	341 aa		2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	CCT6	P39079	546 aa		2.55	□□□□□ -2
BIG1	YHR101C	CIN4	P39110	191 aa		2.55	□□□□□ -2

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