RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPS10BP46784 105 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SAM37P50110 327 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TPO2P53283 614 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ESF2P53743 316 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SIW14P53965 281 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YML131WQ03102 365 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C AIM32Q04689 311 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PEX10Q05568 337 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YOL159CQ08300 171 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BDS1Q08347 646 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PUS7Q08647 676 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TY3A-GQ12173 290 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NFI1Q12216 726 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TRM10Q12400 293 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YOR131CQ12486 218 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C APM4Q99186 491 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TY3A-IQ99219 290 aa5.27□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ABF1P14164 731 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STF2P16965 84 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CIN8P27895 1000 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PET112P33893 541 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CAF4P36130 643 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C KTR4P38131 464 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ECM8P38246 354 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MUP3P38734 546 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C VMA22P38784 181 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MTG2P38860 518 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FCY21P40039 528 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ELO3P40319 345 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MRX6P48564 524 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C KEL2P50090 882 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BOL2P53082 120 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C EFM5P53200 248 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CDC14Q00684 551 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SPR6Q01684 191 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SPP2Q02521 185 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YPL107WQ02873 248 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RSC9Q03124 581 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C TRS31Q03337 283 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YML108WQ03759 105 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YDR131CQ03899 556 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RAD33Q04231 177 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SPO20Q04359 397 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GPI11Q06636 219 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C VAM6Q07468 1049 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FLC1Q08967 793 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SUC2P00724 532 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ERG20P08524 352 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C NFT1P0CE68 1218 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GLN4P13188 809 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C APE1P14904 514 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CBS2P14905 389 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RPB10P22139 70 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C AFT1P22149 690 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C HSP30P25619 332 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PPZ1P26570 692 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CMK1P27466 446 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C UBC8P28263 218 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COX13P32799 129 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C VPS21P36017 210 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SLX1P38324 304 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C STB5P38699 743 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RAD55P38953 406 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C IPT1P38954 527 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C DDI1P40087 428 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COS4P43542 379 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C FAR7P43592 221 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
SSZ1YHR064C GUF1P46943 645 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C UPF3P48412 387 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARO8P53090 500 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C GND2P53319 492 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C IBD2P53892 351 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C BLS1Q06071 122 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YPR196WQ06595 470 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C REH1Q06709 432 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MHF2Q3E829 80 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MHF1Q3E835 90 aa5.26□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C CCP1P00431 361 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C ARG3P05150 338 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C RAD7P06779 565 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MIS1P09440 975 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COS2P0CX12 379 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C COS3P0CX13 379 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C MET16P18408 261 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C YUR1P26725 428 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C PEX3P28795 441 aa5.25□□□□□ -1.57
SSZ1YHR064C SYN8P31377 255 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms