RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W IMP2'P32351 346 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SEF1P34228 1148 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W NUP133P36161 1157 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
NSE4YDL105W FET5P43561 622 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W NGL3Q03210 505 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RTT109Q07794 436 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SDH5Q08230 162 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W CTI6Q08923 506 aa3.27□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W GCN4P03069 281 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SGF29P25554 259 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SYN8P31377 255 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W REG2P38232 338 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W CIN4P39110 191 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W ALG5P40350 334 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W AXL1P40851 1208 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W APT1P49435 187 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W DSD1P53095 428 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YGR066CP53242 292 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YGR126WP53274 230 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YEH2Q07950 538 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W PPT2Q12036 173 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YPT6Q99260 215 aa3.26□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W ART10P18634 518 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W AZF1P41696 914 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RMD8P43620 662 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SNG1P46950 547 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SHR3Q02774 210 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RRI2Q12348 645 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W CSR2Q12734 1121 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YJR112W-AQ3E743 109 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SGS1P35187 1447 aa3.25□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W PEP5P12868 1029 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W CBS1P14066 229 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W GLN3P18494 730 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W TYR1P20049 452 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W BUD14P27637 709 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W VPS17P32913 551 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SPC34P36131 295 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W KRE9P39005 276 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W CCT6P39079 546 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YJL068CP40363 299 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W MRX6P48564 524 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W IPI3P53877 555 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YPL014WQ02606 381 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W MSS11Q03825 758 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W GLO2Q05584 274 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YDL057WQ07379 328 aa3.24□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W ACH1P32316 526 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YTA12P40341 825 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W VPS75P53853 264 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W RHO4Q00246 291 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W VPS38Q05919 439 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W DIC1Q06143 298 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W FMP45Q07651 309 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W MED1Q12321 566 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W AVL9Q12500 764 aa3.23□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data3.22□□□□□ -1.89not detected
NSE4YDL105W MRP13P12686 339 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SEC62P21825 274 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W OCA4P25366 362 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YBR225WP38321 900 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SLX1P38324 304 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W YHR218WP38899 603 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W GUF1P46943 645 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W SAM50P53969 484 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W MSC1Q03104 513 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W VPS72Q03388 795 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W FIN1Q03898 291 aa3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NSE4YDL105W GAL80P04387 435 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MRP7P12687 371 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W CBS2P14905 389 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W YME1P32795 747 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W SWE1P32944 819 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W MSR1P38714 643 aa3.21□□□□□ -1.9
NSE4YDL105W YHR210CP38893 341 aa3.21□□□□□ -1.9
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