RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HER2	Q03557	464 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	IVY1	Q04934	453 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YPS7	Q06325	596 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	BUD7	Q08754	746 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GPM2	Q12008	311 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TAH18	Q12181	623 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YDR262W	Q12331	272 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SFI1	Q12369	946 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GEP5	Q12393	293 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YPR089W	O13585	888 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MTF2	P10849	440 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CTA1	P15202	515 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	OPI1	P21957	404 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MAK32	P23060	363 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YCR043C	P25361	127 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MXR2	P25566	168 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	IMG1	P25626	169 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PMT2	P31382	759 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PHA2	P32452	334 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FUI1	P38196	639 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FIG1	P38224	298 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ICS2	P38284	255 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MSR1	P38714	643 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PZF1	P39933	429 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPH1	P39956	796 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SPO73	P40031	143 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CIS3	P47001	227 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YGL138C	P53122	345 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	WAR1	Q03631	944 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YDR179W-A	Q03983	463 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR087W	Q04299	284 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	STP3	Q05937	343 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ENT4	Q07872	247 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SLX4	Q12098	748 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LAG2	Q92325	660 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	REP1	P03871	373 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COX4	P04037	155 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TPK2	P06245	380 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YAK1	P14680	807 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	APA2	P22108	325 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DAL3	P32459	195 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SRB5	P32585	307 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YME2	P32843	850 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MYO3	P36006	1272 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LHS1	P36016	881 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ARA1	P38115	344 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.47	□□□□□ -2.33	not detected
AI1	Q0050	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	VAC8	P39968	578 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RSM25	P40496	264 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CFD1	P40558	293 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	UFE1	P41834	346 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TDA10	P42938	290 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MNN5	P46982	586 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DIP5	P53388	608 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	AQR1	P53943	586 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PPN1	Q04119	674 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MCM21	Q06675	368 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CRD1	Q07560	283 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SIL1	Q08199	421 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	VPS68	Q12016	184 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FCY22	Q12119	530 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RKI1	Q12189	258 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	0.47	□□□□□ -2.33	not detected
AI1	Q0050	ZRT2	Q12436	422 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RLF2	Q12495	606 aa		0.47	□□□□□ -2.33

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