RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.08■■□□□ 1.45
CSAG3-202ENST00000617158 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CSAG3-202ENST00000617158 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.08■■□□□ 1.45
CSAG3-202ENST00000617158 ABCB11O95342 1321 aa24.08■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 SMCO2A6NFE2 343 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 STAT3P40763 770 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP5P59047 1200 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 RESTQ13127 1097 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 BTBD18B2RXH4 712 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 NFIBO00712 420 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 ALAS1P13196 640 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 H3BQV1 296 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 MEIS2O14770 477 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 BCRP11274 1271 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 ERVK-9P63128 1117 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 ERVK-24P63145 666 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 NR5A1Q13285 461 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 IFFO2Q5TF58 517 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 RNF146Q9NTX7 359 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 LCTP09848 1927 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 FAM205CA6NFA0 338 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 XBP1P17861 261 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 MAP2K2P36507 400 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 ADCY7P51828 1080 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 GHRHRQ02643 423 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CRHR2Q13324 411 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM29Q14134 588 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PLS1Q14651 629 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2SQ16763 222 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 FERMT3Q86UX7 667 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 BLIDQ8IZY5 108 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM260Q9NX78 707 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TKFCQ3LXA3 575 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 C17orf99Q6UX52 265 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 C6orf50Q9HD87 102 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CPA4Q9UI42 421 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.03■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CA12O43570 354 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 F13A1P00488 732 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CALML3P27482 149 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 KRT2P35908 639 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 NUCB2P80303 420 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 TRAF1Q13077 416 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 GALNT17Q6IS24 598 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PORCNQ9H237 461 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 PNMA2Q9UL42 364 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG3-202ENST00000617158 EDIL3O43854 480 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 TLR2O60603 784 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 HSD17B4P51659 736 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 CUL5Q93034 780 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 COL20A1Q9P218 1284 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 PIK3CDO00329 1044 aa24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 ERCC3P19447 782 aa24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 GNA11P29992 359 aa24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 FAM110CQ1W6H9 321 aa24■■□□□ 1.43
CSAG3-202ENST00000617158 MCTP1Q6DN14 999 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms