RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 P2RX5Q93086 422 aa22.19■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.19■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 BTG4Q9NY30 223 aa22.19■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.19■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 KIF5AQ12840 1032 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 UBE4AQ14139 1066 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 INF2Q27J81 1249 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ZNF263O14978 683 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CCNE1P24864 410 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 IQCEQ6IPM2 695 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 HINFPQ9BQA5 517 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 EFCC1Q9HA90 598 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.18■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 MIIPQ5JXC2 388 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 MECOMQ03112 1051 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SEMA3FQ13275 785 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CDK17Q00537 523 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CREG2Q8IUH2 290 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FAM76AQ8TAV0 307 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 KAT14Q9H8E8 782 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SNX12Q9UMY4 172 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FLT1P17948 1338 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 BICDL2A1A5D9 508 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 PLCG1P19174 1290 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 PDE4DQ08499 809 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.16■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 STK4Q13043 487 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CCDC96Q2M329 555 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 PACS2Q86VP3 889 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 CCDC42Q96M95 316 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SLAIN2Q9P270 581 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 A0A1W2PQJ5 194 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 SPA17Q15506 151 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 FIGNQ5HY92 759 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.15■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 TRIM58Q8NG06 486 aa22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 TRIM9Q9C026 710 aa22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.14■■□□□ 1.14
ILF3-217ENST00000589998 ADAMTS2O95450 1211 aa22.14■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 FCER1AP12319 257 aa22.14■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.14■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 PNMA1Q8ND90 353 aa22.14■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.14■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 CABP7Q86V35 215 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 DRC1Q96MC2 740 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 CUEDC2Q9H467 287 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 SH2D4AQ9H788 454 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 ASIC1P78348 528 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 SBK1Q52WX2 424 aa22.13■■□□□ 1.13
ILF3-217ENST00000589998 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms