RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB10O96000 172 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PDHBP11177 359 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 LIFRP42702 1097 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 NOVP48745 357 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGCS2P54868 508 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRC3Q07444 240 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 TROAPQ12815 778 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 GRM4Q14833 912 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 RTN1Q16799 776 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 DGKHQ86XP1 1220 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 OPTNQ96CV9 577 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PICK1Q9NRD5 415 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 NYAP2Q9P242 653 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PASKQ96RG2 1323 aa7.02□□□□□ -1.28
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF6O14896 467 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTS3O15072 1205 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CYTH3O43739 400 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 DDAH1O94760 285 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ASNSP08243 561 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 EVCP57679 992 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCY1B3Q02153 619 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CUL4AQ13619 759 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 HIC1Q14526 733 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD1Q15327 319 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 NTRK3Q16288 839 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K11Q16584 847 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 TREML2Q5T2D2 321 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCBQ8NB91 859 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SHISA4Q96DD7 197 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 HOOK2Q96ED9 719 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 WNK4Q96J92 1243 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP42Q96MM3 310 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZIC5Q96T25 663 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 TMX2Q9Y320 296 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CSADQ9Y600 493 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPRFP10586 1907 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L10C9JJH3 530 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM232C9JQI7 657 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRF2D3W0D1 207 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 TOMM70O94826 608 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 VCAM1P19320 739 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 GJB2P29033 226 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC1A4P43007 532 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 HUNKP57058 714 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF543Q08ER8 600 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PKP1Q13835 747 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 BECN1Q14457 450 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 HOMER1Q86YM7 354 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL16Q8N461 479 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 MKL1Q969V6 931 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGSQ96S52 555 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 VCPKMTQ9H867 229 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-208ENST00000589162 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.01□□□□□ -1.29
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