RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 RNF180Q86T96 592 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 PFASO15067 1338 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-214ENST00000583153 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-214ENST00000583153 COL6A1P12109 1028 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-214ENST00000583153 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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PTPRM-214ENST00000583153 SNHG28P0DPA3 235 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-214ENST00000583153 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRM-214ENST00000583153 TNFAIP2Q03169 654 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRM-214ENST00000583153 FGD4Q96M96 766 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRM-214ENST00000583153 B4DLN1 442 aa9.69□□□□□ -0.86
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PTPRM-214ENST00000583153 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 RTP1P59025 263 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 SEC23AQ15436 765 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 KCNA10Q16322 511 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 RNF20Q5VTR2 975 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-214ENST00000583153 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.69□□□□□ -0.86
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