RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 ISM2Q6H9L7 571 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-212ENST00000568900 FBXO11Q86XK2 927 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-212ENST00000568900 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.71■■□□□ 1.39
SPNS1-212ENST00000568900 IQCB1Q15051 598 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 POSTNQ15063 836 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 AP5Z1O43299 807 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 ADCY5O95622 1261 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 FEZ1Q99689 392 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.7■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 EPS15P42566 896 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 KANK3Q6NY19 840 aa23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L15C9J2P7 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L11C9JVI0 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L18D6R9N7 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L22D6RA61 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L19D6RCP7 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L20D6RJB6 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 OR52Z1P0C646 297 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 PRR29P0C7W0 189 aa23.68■■□□□ 1.38
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SPNS1-212ENST00000568900 PRPHP41219 470 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L24Q0WX57 530 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.68■■□□□ 1.38
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SPNS1-212ENST00000568900 CDC25AP30304 524 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 GGA3Q9NZ52 723 aa23.68■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 SLFN14P0C7P3 912 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 POTEDQ86YR6 584 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 RNF181Q9P0P0 153 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 BECN2A8MW95 431 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 EDIL3O43854 480 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 TDP2O95551 362 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 TXLNAP40222 546 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 KIFC2Q96AC6 838 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.67■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 INPP5BP32019 993 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 DCAF15Q66K64 600 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 PP2D1A8MPX8 630 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 AFMP43652 599 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 IQUBQ8NA54 791 aa23.66■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 PAGE5Q96GU1 130 aa23.65■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 SLC37A4O43826 429 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 E2F4Q16254 413 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 SMARCE1Q969G3 411 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-212ENST00000568900 DOCK1Q14185 1865 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 MEIS2O14770 477 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 CALCRLQ16602 461 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC174Q6PII3 467 aa23.64■■□□□ 1.37
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SPNS1-212ENST00000568900 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 FAM160B2Q86V87 743 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 FEM1BQ9UK73 627 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 UBA7P41226 1012 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 HOOK2Q96ED9 719 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 BPIFA3Q9BQP9 254 aa23.63■■□□□ 1.37
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SPNS1-212ENST00000568900 TECP42680 631 aa23.62■■□□□ 1.37
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SPNS1-212ENST00000568900 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.62■■□□□ 1.37
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SPNS1-212ENST00000568900 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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SPNS1-212ENST00000568900 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.62■■□□□ 1.37
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SPNS1-212ENST00000568900 WRNIP1Q96S55 665 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 OPLAHO14841 1288 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 STAT6P42226 847 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 AP3B2Q13367 1082 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 DGKZQ13574 1117 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-212ENST00000568900 AK8Q96MA6 479 aa23.61■■□□□ 1.37
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