RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP10-208ENST00000563386 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 ARMCX2Q7L311 632 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 LY9Q9HBG7 655 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 CALML3P27482 149 aa22.02■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 FBXO11Q86XK2 927 aa22.02■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.02■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.02■■□□□ 1.12
USP10-208ENST00000563386 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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USP10-208ENST00000563386 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 TROAPQ12815 778 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 TMEM87BQ96K49 555 aa22.01■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 NEK1Q96PY6 1258 aa22.01■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 ASB14A6NK59 587 aa22■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 RARBP10826 455 aa22■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 ACVR2BQ13705 512 aa22■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 HOMER1Q86YM7 354 aa22■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 PIBF1Q8WXW3 757 aa22■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 REC8O95072 547 aa21.99■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 AKR1A1P14550 325 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.99■■□□□ 1.11
USP10-208ENST00000563386 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 ABCB11O95342 1321 aa21.99■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 AMNQ9BXJ7 453 aa21.97■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.97■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 LRRC41Q15345 812 aa21.96■■□□□ 1.11
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USP10-208ENST00000563386 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 FGD1P98174 961 aa21.95■■□□□ 1.1
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USP10-208ENST00000563386 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.95■■□□□ 1.1
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USP10-208ENST00000563386 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.95■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.95■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.95■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 LCTP09848 1927 aa21.94■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 CYTH3O43739 400 aa21.94■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 HSPA4P34932 840 aa21.94■■□□□ 1.1
USP10-208ENST00000563386 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.94■■□□□ 1.1
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