RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 GUCD1Q96NT3 240 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A1W2PQY0 241 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 OAZ1P54368 228 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF543Q08ER8 600 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TRDNQ13061 729 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM160B2Q86V87 743 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 PNMA1Q8ND90 353 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 NCOA7Q8NI08 942 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TOX2Q96NM4 488 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 SENP2Q9HC62 589 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 RIPK3Q9Y572 518 aa23.46■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF536O15090 1300 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA0355O15063 1070 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS4O75173 837 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 RAG1P15918 1043 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC96Q2M329 555 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 RASEFQ8IZ41 740 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CHST13Q8NET6 341 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SPC25Q9HBM1 224 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.45■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC16A2P36021 539 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ACLYP53396 1101 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CHST3Q7LGC8 479 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CPXCR1Q8N123 301 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM161BQ96MY7 647 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNB2Q92953 911 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 KAT14Q9H8E8 782 aa23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC4A3P48751 1232 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SNAP25P60880 206 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 FPGSQ05932 587 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ELP1O95163 1332 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ACVR2BQ13705 512 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNA10Q16322 511 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CPVLQ9H3G5 476 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-210ENST00000559586 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC174Q6PII3 467 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 LY9Q9HBG7 655 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.39■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 PRC1O43663 620 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA4P34932 840 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 FAAP100Q0VG06 881 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 TROAPQ12815 778 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF20Q5VTR2 975 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 MTA3Q9BTC8 594 aa23.38■■□□□ 1.33
RABGGTA-210ENST00000559586 TIMP1P01033 207 aa23.37■■□□□ 1.33
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