RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ASTN1	O14525	1302 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	SNAP25	P60880	206 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TRDN	Q13061	729 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	PGK1	P00558	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	GJA9	P57773	515 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	RTP1	P59025	263 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	NFIB	O00712	420 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ADCY6	O43306	1168 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137		Q9Y3F1	56 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137		E7EWF7	191 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	SYN1	P17600	705 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ACLY	P53396	1101 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	LCT	P09848	1927 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ELP1	O95163	1332 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PQY0	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CTAGE5	O15320	804 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	EDNRB	P24530	442 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	GHRHR	Q02643	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	KCNA10	Q16322	511 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ABCB11	O95342	1321 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TLE2	Q04725	743 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TROAP	Q12815	778 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	SZT2	Q5T011	3432 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CS-223	ENST00000551137	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	ERICH2	A1L162	156 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137		B4DLN1	442 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	SMPD1	P17405	629 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	CDK7	P50613	346 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	ANTXR2	P58335	489 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CS-223	ENST00000551137	GRM4	Q14833	912 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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