RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		24.4	■■□□□ 1.5
CS-222	ENST00000550996	DNM1L	O00429	736 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ADCY6	O43306	1168 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		24.39	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	24.39	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	EVI5	O60447	810 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ACVR2B	Q13705	512 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	LRRC41	Q15345	812 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		24.38	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	LCT	P09848	1927 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	RARB	P10826	455 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	AKR1A1	P14550	325 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	TROAP	Q12815	778 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	GRM4	Q14833	912 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	WTAP	Q15007	396 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	USH1G	Q495M9	461 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	LY9	Q9HBG7	655 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		24.37	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	MCM3AP	O60318	1980 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	KLRF2	D3W0D1	207 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PGK1	P00558	417 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		24.36	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ERICH2	A1L162	156 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PRC1	O43663	620 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ADAMTS4	O75173	837 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	MTMR8	Q96EF0	704 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PNMA2	Q9UL42	364 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		24.35	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	RASEF	Q8IZ41	740 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	MORC4	Q8TE76	937 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	TBC1D5	Q92609	795 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		24.34	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	ASB14	A6NK59	587 aa		24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	CALML3	P27482	149 aa		24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	CASC1	Q6TDU7	716 aa		24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	MYL10	Q9BUA6	226 aa		24.33	■■□□□ 1.49
CS-222	ENST00000550996	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	MYADML2	A6NDP7	307 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	KBTBD13	C9JR72	458 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	CYTH3	O43739	400 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	PTGS1	P23219	599 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	MCM5	P33992	734 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		24.32	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	LAMA3	Q16787	3333 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	FBXO11	Q86XK2	927 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	FERMT2	Q96AC1	680 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	MTA3	Q9BTC8	594 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	PHF24	Q9UPV7	400 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ABCB11	O95342	1321 aa		24.31	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	OPLAH	O14841	1288 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	RGS22	Q8NE09	1264 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	PRO3102	Q9H379	93 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	COL20A1	Q9P218	1284 aa		24.3	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	CTAGE5	O15320	804 aa		24.29	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	24.29	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		24.29	■■□□□ 1.48
CS-222	ENST00000550996	RNF180	Q86T96	592 aa		24.29	■■□□□ 1.48

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