RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550672.5

SLC8B1-211, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC8B1, Length 2,925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SLC8B1-211ENST00000550672 SEC24CP53992 1094 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC8B1-211ENST00000550672 HERVK_113P62684 666 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC8B1-211ENST00000550672 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC8B1-211ENST00000550672 KCNJ12Q14500 433 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.58□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 CHD4Q14839 1912 aa14.58□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 C4BP0C0L5 1744 aa14.57□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.57□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 KRT86O43790 486 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 HSF2BPO75031 334 aa14.56□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SPATA20Q8TB22 786 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.56□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 ZNF174Q15697 407 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 NELFBQ8WX92 580 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SCLT1Q96NL6 688 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SH3GL2Q99962 352 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SCN7AQ01118 1682 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 ESYT3A0FGR9 886 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 CLSTN1O94985 981 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 NEDD9Q14511 834 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC8B1-211ENST00000550672 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.55□□□□□ -0.08
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SLC8B1-211ENST00000550672 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.55□□□□□ -0.08
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