RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 C6orf50Q9HD87 102 aa23.51■■□□□ 1.35
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TSTA3-215ENST00000532308 CA12O43570 354 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 STX6O43752 255 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 SLC25A27O95847 323 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 GNA11P29992 359 aa23.5■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
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TSTA3-215ENST00000532308 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.49■■□□□ 1.35
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TSTA3-215ENST00000532308 MCTP1Q6DN14 999 aa23.44■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 ERCC3P19447 782 aa23.43■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 OPLAHO14841 1288 aa23.42■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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TSTA3-215ENST00000532308 BTBD18B2RXH4 712 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 TRPA1O75762 1119 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 BRD1O95696 1058 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 GHRHRQ02643 423 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 NSMFQ6X4W1 530 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSTA3-215ENST00000532308 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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