RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 NFIAQ12857 509 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PAK1Q13153 545 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CUL4BQ13620 913 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 IL17AQ16552 155 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CALCRLQ16602 461 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 AOC3Q16853 763 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 MCTP2Q6DN12 878 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TBCKQ8TEA7 893 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PHF12Q96QT6 1004 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CPVLQ9H3G5 476 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.39□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ZBTB5O15062 677 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ADAMTS3O15072 1205 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 MARCH6O60337 910 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PYGBP11216 843 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 BAG6P46379 1132 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TNNI2P48788 182 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ICA1Q05084 483 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TCP10Q12799 353 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TRAF1Q13077 416 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 KCNB1Q14721 858 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ARID5BQ14865 1188 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PTPN14Q15678 1187 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CEP135Q66GS9 1140 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SLFN13Q68D06 897 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TTLL6Q8N841 843 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 STK17AQ9UEE5 414 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.38□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 A0A1B0GTH6 734 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PSMA7O14818 248 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ZSCAN12O43309 604 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SLC26A4O43511 780 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 RAD21O60216 631 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PLCG1P19174 1290 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SLC1A4P43007 532 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 STX17P56962 302 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 NELFBQ8WX92 580 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 DPF2Q92785 391 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 MKL1Q969V6 931 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 COA7Q96BR5 231 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 MAP7D2Q96T17 732 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 EXOC1Q9NV70 894 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PSME4Q14997 1843 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SCN9AQ15858 1988 aa8.37□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 SIPA1L1O43166 1804 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 BICDL2A1A5D9 508 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 PP2D1A8MPX8 630 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM232C9JQI7 657 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 H7C1D1 291 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 ARHGAP6O43182 974 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 C21orf2O43822 256 aa8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
UBXN8-204ENST00000518059 CASP1P29466 404 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms