RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.89■□□□□ 0.62
TOM1-216ENST00000492723 SPDYE6P0CI01 402 aa18.89■□□□□ 0.62
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TOM1-216ENST00000492723 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
TOM1-216ENST00000492723 PTPN21Q16825 1174 aa18.89■□□□□ 0.62
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TOM1-216ENST00000492723 CUL5Q93034 780 aa18.89■□□□□ 0.62
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TOM1-216ENST00000492723 USP17L15C9J2P7 530 aa18.84■□□□□ 0.61
TOM1-216ENST00000492723 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.84■□□□□ 0.61
TOM1-216ENST00000492723 USP17L11C9JVI0 530 aa18.84■□□□□ 0.61
TOM1-216ENST00000492723 USP17L18D6R9N7 530 aa18.84■□□□□ 0.61
TOM1-216ENST00000492723 USP17L22D6RA61 530 aa18.84■□□□□ 0.61
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TOM1-216ENST00000492723 RWDD2AQ9UIY3 292 aa18.84■□□□□ 0.61
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TOM1-216ENST00000492723 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.6
TOM1-216ENST00000492723 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.83■□□□□ 0.6
TOM1-216ENST00000492723 KMT5BQ4FZB7 885 aa18.83■□□□□ 0.6
TOM1-216ENST00000492723 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.83■□□□□ 0.6
TOM1-216ENST00000492723 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.83■□□□□ 0.6
TOM1-216ENST00000492723 NELFBQ8WX92 580 aa18.83■□□□□ 0.6
TOM1-216ENST00000492723 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.83■□□□□ 0.6
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