RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	KIF5B	P33176	963 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	CYP2C19	P33261	490 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	RUFY3	Q7L099	469 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FBXL16	Q8N461	479 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FANCB	Q8NB91	859 aa		30.01	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	LCT	P09848	1927 aa		30	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	RPTOR	Q8N122	1335 aa		30	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	NFIB	O00712	420 aa		30	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	USH1G	Q495M9	461 aa		30	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FGD4	Q96M96	766 aa		30	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		30	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	MCM3AP	O60318	1980 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	MICU3	Q86XE3	530 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FBXO11	Q86XK2	927 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PIGS	Q96S52	555 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		29.99	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB5	O15062	677 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	GJB1	P08034	283 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	SMARCA1	P28370	1054 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FGD1	P98174	961 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	CNTN2	Q02246	1040 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	NSMF	Q6X4W1	530 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	BRF1	Q92994	677 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	29.98	■■■□□ 2.39	2e-10	■□□□□ 9.5
TTC3-223	ENST00000492275	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		29.98	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PFAS	O15067	1338 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB43	O43298	467 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	GNAQ	P50148	359 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	APOBR	Q0VD83	1088 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	TRPV1	Q8NER1	839 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	TINF2	Q9BSI4	451 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	ABCB11	O95342	1321 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	POTEB2	H3BUK9	544 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	ANAPC15	P60006	121 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	HOMER1	Q86YM7	354 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	IL17RA	Q96F46	866 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	AMN	Q9BXJ7	453 aa		29.96	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		29.95	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	RGS19	P49795	217 aa		29.95	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		29.95	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		29.95	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
TTC3-223	ENST00000492275	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	GJA8	P48165	433 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	TBC1D5	Q92609	795 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	DEFB118	Q96PH6	123 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	ASTN1	O14525	1302 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	SGPL1	O95470	568 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	CYBA	P13498	195 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RGS22	Q8NE09	1264 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	SHISA4	Q96DD7	197 aa		29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RCAN1	P53805	252 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	EVC	P57679	992 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RTN1	Q16799	776 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		29.92	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	BRCA2	P51587	3418 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	OPLAH	O14841	1288 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	CDC27	P30260	824 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		29.91	■■■□□ 2.38
TTC3-223	ENST00000492275	CALML3	P27482	149 aa		29.9	■■■□□ 2.38

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