RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 ACAD9Q9H845 621 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 CDKL5O76039 1030 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 FBXO40Q9UH90 709 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD10-202ENST00000490088 NFIBO00712 420 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PTPREP23469 700 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PKN1Q16512 942 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MMP19Q99542 508 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MGAMO43451 1857 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 JAK2O60674 1132 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 FCER1AP12319 257 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SCG2P13521 617 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 TRAF1Q13077 416 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MYH6P13533 1939 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 ARHGEF6Q15052 776 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 NSMFQ6X4W1 530 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SNX21Q969T3 373 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 GABRQQ9UN88 632 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 TRIM17Q9Y577 477 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 STK36Q9NRP7 1315 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 STRNO43815 780 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 ADORA2AP29274 412 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PRKCZQ05513 592 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 GRB14Q14449 540 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 KCTD2Q14681 263 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MORN1Q5T089 497 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 DDX11Q96FC9 970 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 GJD2Q9UKL4 321 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PLXNB2O15031 1838 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 STXBP3O00186 592 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 OPLAHO14841 1288 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 DEXIO95424 95 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 GNRH1P01148 92 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 HOXD10P28358 340 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 TBC1D5Q92609 795 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 BARHL2Q9NY43 387 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SRRDQ9UH36 339 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PGK2P07205 417 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 NAPAP54920 295 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 HSCBQ8IWL3 235 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 AIFM3Q96NN9 605 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 FLT3LGP49771 235 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MAP2K5Q13163 448 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 USP6NLQ92738 828 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD10-202ENST00000490088 PFASO15067 1338 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 COBLO75128 1261 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 CFBP00751 764 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 CYP2B6P20813 491 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 DPP9Q86TI2 863 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 CALML3P27482 149 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 RGS2P41220 211 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 CUL4AQ13619 759 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 RGS22Q8NE09 1264 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 SHISA4Q96DD7 197 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD10-202ENST00000490088 POTEB2H3BUK9 544 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms