RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ELP1	O95163	1332 aa		20.23	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SYN1	P17600	705 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	TRDN	Q13061	729 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC174	Q6PII3	467 aa		20.22	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424		B4DLN1	442 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424		B4E1Z4	1266 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SGSM2	O43147	1006 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A2	P36021	539 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTN2	Q02246	1040 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO1	Q5XXA6	986 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	SKAP1	Q86WV1	359 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	TDH	Q8IZJ6	230 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	DNER	Q8NFT8	737 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MTA3	Q9BTC8	594 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	VTA1	Q9NP79	307 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		20.21	■□□□□ 0.83
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC45	O75419	566 aa		20.2	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	PGK1	P00558	417 aa		20.2	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		20.2	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP4K1	Q92918	833 aa		20.2	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	20.2	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		20.2	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQY0	241 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ACLY	P53396	1101 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAF1	Q13077	416 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	NSMF	Q6X4W1	530 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	IL25	Q9H293	177 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR7	Q9Y216	660 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TNKS	O95271	1327 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM3AP	O60318	1980 aa		20.19	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	CABYR	O75952	493 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFAIP2	Q03169	654 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC23A	Q15436	765 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	20.18	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP21A2	P08686	494 aa		20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNA10	Q16322	511 aa		20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SZT2	Q5T011	3432 aa		20.17	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMA4	Q16363	1823 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAP25	P60880	206 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TLE2	Q04725	743 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOA7	Q8NI08	942 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	FERMT2	Q96AC1	680 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ASTN1	O14525	1302 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCB11	O95342	1321 aa		20.16	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	NFIB	O00712	420 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0355	O15063	1070 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ZEB2	O60315	1214 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	EDNRB	P24530	442 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK7	P50613	346 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM60	Q495X7	471 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		20.15	■□□□□ 0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	ERICH2	A1L162	156 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	ASGR1	P07306	291 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CLTB	P09497	229 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	GHRHR	Q02643	423 aa		20.14	■□□□□ 0.81

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