RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LAMA4Q16363 1823 aa7.32□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ADORA2AP29274 412 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MRE11P49959 708 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PTGDRQ13258 359 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SBK1Q52WX2 424 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 VPS53Q5VIR6 699 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LBX2Q6XYB7 198 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 DPP9Q86TI2 863 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TTC13Q8NBP0 860 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TRPV1Q8NER1 839 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SH2D4AQ9H788 454 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GOPCQ9HD26 462 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 HOXC10Q9NYD6 342 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LCTP09848 1927 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.31□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FSD2A1L4K1 749 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 COBLO75128 1261 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PGK2P07205 417 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SYN1P17600 705 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GRB14Q14449 540 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 KRT32Q14532 448 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ANKRD1Q15327 319 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FAM227BQ96M60 508 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NAPBQ9H115 298 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MTMR7Q9Y216 660 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LAMA3Q16787 3333 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FOXP2O15409 715 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 BRD1O95696 1058 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NDUFB10O96000 172 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GNAT2P19087 354 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TFAP4Q01664 338 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PPARAQ07869 468 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LPAR1Q92633 364 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MAP4K1Q92918 833 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CEP95Q96GE4 821 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TTC14Q96N46 770 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.3□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PFASO15067 1338 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 A0A0D9SFI3 127 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 F5H6K3 240 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 VWA5AO00534 786 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NMT2O60551 498 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MBD3O95983 291 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TSPY3P0CV98 308 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TSPY8P0CW00 308 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SNAP25P60880 206 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 KLRC3Q07444 240 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NECTIN1Q15223 517 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CPXCR1Q8N123 301 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 KIFC2Q96AC6 838 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MMP19Q99542 508 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NACAP1Q9BZK3 213 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LTBP2Q14767 1821 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RNF40O75150 1001 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FCER1AP12319 257 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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