RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRO3102Q9H379 93 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERICH2A1L162 156 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADAMTS4O75173 837 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 CPVLQ9H3G5 476 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHF24Q9UPV7 400 aa22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC10-208ENST00000469521 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC34A2O95436 690 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 PGK1P00558 417 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNX17Q15036 470 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 LTBP2Q14767 1821 aa22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPDC1A2A3K4 754 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC30A10Q6XR72 485 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF207Q6ZRF8 634 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MORC4Q8TE76 937 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAF1Q9H063 256 aa22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADCY6O43306 1168 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTP1P59025 263 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 WTAPQ15007 396 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 USH1GQ495M9 461 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CASC1Q6TDU7 716 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABCB11O95342 1321 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A1W2PPC1 479 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANTXR2P58335 489 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRM4Q14833 912 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGS22Q8NE09 1264 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTA3Q9BTC8 594 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 VTA1Q9NP79 307 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A1W2PQY0 241 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLRF2D3W0D1 207 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDC45O75419 566 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 NEFLP07196 543 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYN1P17600 705 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CALML3P27482 149 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 GDF15Q99988 308 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPC25Q9HBM1 224 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC27A2O14975 620 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 BMP8BP34820 402 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 GJA9P57773 515 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 NKX3-2P78367 333 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 NECTIN1Q15223 517 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHST3Q7LGC8 479 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNERQ8NFT8 737 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 FERMT2Q96AC1 680 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 SENP2Q9HC62 589 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC10-208ENST00000469521 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACLYP53396 1101 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNFAIP2Q03169 654 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TROAPQ12815 778 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM60Q495X7 471 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO11Q86XK2 927 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTMR8Q96EF0 704 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms