RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GVL5 298 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 GBP6Q6ZN66 633 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 NLRX1Q86UT6 975 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PPM1EQ8WY54 764 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 FBXO40Q9UH90 709 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 UBA7P41226 1012 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 NLRP12P59046 1061 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 TTC38Q5R3I4 469 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 CBX8Q9HC52 389 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 TTLL1O95922 423 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ERO1AQ96HE7 468 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 EHD4Q9H223 541 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 SAMM50Q9Y512 469 aa8.57□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SETSIPP0DME0 302 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PTPREP23469 700 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 USP37Q86T82 979 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 BLIDQ8IZY5 108 aa8.56□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 CDC25BP30305 580 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 KCTD2Q14681 263 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PTPAQ15257 358 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 MICALL2Q8IY33 904 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.56□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 DMTNQ08495 405 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.56□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 CAPN2P17655 700 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 RHBDL3P58872 404 aa8.56□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 POTEDQ86YR6 584 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 DPF2Q92785 391 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.56□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 TSG101Q99816 390 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 SARM1Q6SZW1 724 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.55□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 DESP17661 470 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 GUCY1A2P33402 732 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PAFAH1B1P43034 410 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SREBF2Q12772 1141 aa8.55□□□□□ -1.04
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USP54-210ENST00000466048 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.55□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PKN1Q16512 942 aa8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 HPSEQ9Y251 543 aa8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 OPA1O60313 960 aa8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 ADCY7P51828 1080 aa8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 SEMA3FQ13275 785 aa8.54□□□□□ -1.04
USP54-210ENST00000466048 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.54□□□□□ -1.04
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