RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EVCP57679 992 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IKQ13123 557 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LHX8Q68G74 356 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MORC4Q8TE76 937 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF146Q9NTX7 359 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTMR7Q9Y216 660 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PFASO15067 1338 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.09□□□□□ -0.31
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYTH3O43739 400 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PGK2P07205 417 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYBAP13498 195 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNAP25P60880 206 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF654Q8IZM8 581 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRPV1Q8NER1 839 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPZ1Q9BXG8 430 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CPVLQ9H3G5 476 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.08□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB5O15062 677 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MSCO60682 206 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALM1P0DP23 149 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALM2P0DP24 149 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CALM3P0DP25 149 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ALAS1P13196 640 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP2C19P33261 490 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP2R5BQ15173 497 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC174Q6PII3 467 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DDX11Q96FC9 970 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFB118Q96PH6 123 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KATNBL1Q9H079 304 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.07□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEPT4O43236 478 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GABBR2O75899 941 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMA5P28066 241 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIF5BP33176 963 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNAQP50148 359 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANAPC15P60006 121 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRAF1Q13077 416 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FANCBQ8NB91 859 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASTN1O14525 1302 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABCB11O95342 1321 aa13.06□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POTEB2H3BUK9 544 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFIBO00712 420 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OPLAHO14841 1288 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPS6KB1P23443 525 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNTN2Q02246 1040 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FUT2Q10981 343 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APOA5Q6Q788 366 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXO11Q86XK2 927 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AMNQ9BXJ7 453 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NID2Q14112 1375 aa13.05□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC69A6NI79 296 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EDNRBP24530 442 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKX3-2P78367 333 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RUFY3Q7L099 469 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TEX2Q8IWB9 1127 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNERQ8NFT8 737 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC2Q9BYS8 371 aa13.04□□□□□ -0.32
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms