RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 DGKHQ86XP1 1220 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 KRT23Q9C075 422 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.13■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 KDM4AO75164 1064 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 GPR153Q6NV75 609 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.12■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 NEDD4P46934 1319 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 RAG1P15918 1043 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF543Q08ER8 600 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 BADQ92934 168 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 FGD4Q96M96 766 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.11■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 B4E1Z4 1266 aa22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZEB2O60315 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ASGR1P07306 291 aa22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 GJA9P57773 515 aa22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.1■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 B4DLN1 442 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRDNQ13061 729 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTC22Q5TAA0 569 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 DEFB123Q8N688 67 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 PNMA1Q8ND90 353 aa22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 ELP1O95163 1332 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 LAMA4Q16363 1823 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 CALML3P27482 149 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 TOX2Q96NM4 488 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 VTA1Q9NP79 307 aa22.08■■□□□ 1.13
LIN28AP1-201ENST00000429574 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYADML2A6NDP7 307 aa22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 TLK2Q86UE8 772 aa22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.07■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 NFIBO00712 420 aa22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 USH1GQ495M9 461 aa22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 LTBP2Q14767 1821 aa22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 RAD50Q92878 1312 aa22.06■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 CABYRO75952 493 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 SNHG28P0DPA3 235 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 BEX3Q00994 111 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDE4DQ08499 809 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 KATNBL1Q9H079 304 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 TNKSO95271 1327 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.05■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARVCFO00192 962 aa22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 KIAA0355O15063 1070 aa22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADCY6O43306 1168 aa22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDE4AP27815 886 aa22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 SHHQ15465 462 aa22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 Q9Y3F1 56 aa22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ERICH2A1L162 156 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 SMPD1P17405 629 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 FPGSQ05932 587 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAAP100Q0VG06 881 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 Q7L0L9 218 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ANKS1AQ92625 1134 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms