RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.19■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POTEB2H3BUK9 544 aa20.18■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPA1P15085 419 aa20.18■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NSMFQ6X4W1 530 aa20.18■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MICU3Q86XE3 530 aa20.18■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO11Q86XK2 927 aa20.18■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.18■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB5O15062 677 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHA2P01877 340 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RXRAP19793 462 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS6KB1P23443 525 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GJA8P48165 433 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOA5Q6Q788 366 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOMER1Q86YM7 354 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTMR8Q96EF0 704 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEFB118Q96PH6 123 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TINF2Q9BSI4 451 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMNQ9BXJ7 453 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCB11O95342 1321 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFIBO00712 420 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAF1Q13077 416 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q6ZUG5 572 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCBQ8NB91 859 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTPDC1A2A3K4 754 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB43O43298 467 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYTH3O43739 400 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SGPL1O95470 568 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYBAP13498 195 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPN2P17655 700 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMARCA1P28370 1054 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RUFY3Q7L099 469 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIGSQ96S52 555 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNGA1P29973 690 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RCAN1P53805 252 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANAPC15P60006 121 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNTN2Q02246 1040 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXL16Q8N461 479 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRF1Q92994 677 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSCO60682 206 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTN1Q16799 776 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHISA4Q96DD7 197 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGD4Q96M96 766 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAF1Q9H063 256 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALML3P27482 149 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOBRQ0VD83 1088 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C8orf34Q49A92 452 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGS22Q8NE09 1264 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRPV1Q8NER1 839 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.12■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASB14A6NK59 587 aa20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEPT4O43236 478 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms