RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360564.5

MMP17-201, Transcript of matrix metallopeptidase 17, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP17, Length 2,411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17-201ENST00000360564 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 ANO10Q9NW15 660 aa23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 H7C1D1 291 aa23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 PNOCQ13519 176 aa23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 TBCKQ8TEA7 893 aa23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.53■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 BIN1O00499 593 aa23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 UBE2SQ16763 222 aa23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MMP17-201ENST00000360564 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 BECN2A8MW95 431 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 FOXN1O15353 648 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 GOPCQ9HD26 462 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 A0A087X0B3 334 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 SBF1O95248 1867 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ASNSP08243 561 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 NEK8Q86SG6 692 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 CUL5Q93034 780 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.51■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ISM2Q6H9L7 571 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 GPC2Q8N158 579 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.5■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 DHX58Q96C10 678 aa23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 SYT17Q9BSW7 474 aa23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 STAT2P52630 851 aa23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.49■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 CDC25AP30304 524 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USH1GQ495M9 461 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 VCPKMTQ9H867 229 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.48■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 NEMFO60524 1076 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 EPS15P42566 896 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 AMNQ9BXJ7 453 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L15C9J2P7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L11C9JVI0 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L18D6R9N7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L22D6RA61 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L19D6RCP7 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L20D6RJB6 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L24Q0WX57 530 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 LRMPQ12912 555 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 POSTNQ15063 836 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.47■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 FBXO11Q86XK2 927 aa23.46■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.46■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 SH2D4AQ9H788 454 aa23.46■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.46■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 PRR29P0C7W0 189 aa23.45■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 FEZ1Q99689 392 aa23.45■■□□□ 1.35
MMP17-201ENST00000360564 LAD1O00515 517 aa23.45■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 NLRP12P59046 1061 aa23.45■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.45■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 GGA3Q9NZ52 723 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 PP2D1A8MPX8 630 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 EDIL3O43854 480 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.345e-7■■■□□ 17.8
MMP17-201ENST00000360564 POTEDQ86YR6 584 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 KIFC2Q96AC6 838 aa23.44■■□□□ 1.34
MMP17-201ENST00000360564 RNF181Q9P0P0 153 aa23.44■■□□□ 1.34
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