RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 HOMER1Q86YM7 354 aa31.02■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 ADORA2AP29274 412 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 CDC27P30260 824 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 ADD1P35611 737 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 DPP9Q86TI2 863 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC82Q8N4S0 544 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 DDX11Q96FC9 970 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.01■■■□□ 2.56
CRIP1-201ENST00000330233 ABCB11O95342 1321 aa31.01■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 USH1GQ495M9 461 aa31■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD35Q8N283 1001 aa31■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 PXYLP1Q8TE99 480 aa31■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 MAF1Q9H063 256 aa31■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa31■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 HOXC6P09630 235 aa30.99■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 CYP2B6P20813 491 aa30.99■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa30.99■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY3O60266 1144 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 CCT2P78371 535 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 MUM1L1Q5H9M0 696 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 APBA2Q99767 749 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 TPCN1Q9ULQ1 816 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 PFASO15067 1338 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 SLAIN1Q8ND83 568 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 RGS22Q8NE09 1264 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 GRK4P32298 578 aa30.97■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 FUT2Q10981 343 aa30.97■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC4DQ8WXI8 215 aa30.97■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 COBLO75128 1261 aa30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 STK3Q13188 491 aa30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 MCF2L2Q86YR7 1114 aa30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 V9GY48 417 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CRIP1-201ENST00000330233 CPLX1O14810 134 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ST18O60284 1047 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 PFKFB2O60825 505 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 NSMFQ6X4W1 530 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 CYP39A1Q9NYL5 469 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa30.95■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa30.94■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 PGK2P07205 417 aa30.94■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 IFNAR1P17181 557 aa30.94■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF792Q3KQV3 632 aa30.94■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 SAMD3Q8N6K7 520 aa30.94■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 NFIBO00712 420 aa30.93■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 NTRK3Q16288 839 aa30.93■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 NPLOC4Q8TAT6 608 aa30.93■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 POTEB2H3BUK9 544 aa30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 RNF207Q6ZRF8 634 aa30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 TNS4Q8IZW8 715 aa30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 PTPDC1A2A3K4 754 aa30.91■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ELNP15502 786 aa30.91■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 SCRN1Q12765 414 aa30.91■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ME3Q16798 604 aa30.91■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 OLFML2BQ68BL8 750 aa30.91■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 hCG_1984214I3L0E3 225 aa30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 CDKL5O76039 1030 aa30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 HMGCRP04035 888 aa30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM22Q8IYM9 498 aa30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 MAML3Q96JK9 1138 aa30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 UBXN2AP68543 259 aa30.89■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 FAM133AQ8N9E0 248 aa30.89■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 TRIB2Q92519 343 aa30.89■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 ARMC5Q96C12 935 aa30.89■■■□□ 2.54
CRIP1-201ENST00000330233 RPS6P62753 249 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 CCL14Q16627 93 aa30.88■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 MFSD14CQ5VZR4 134 aa30.88■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 SH3TC2Q8TF17 1288 aa30.88■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 PHKBQ93100 1093 aa30.88■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 CNTN2Q02246 1040 aa30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms