RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 NUCB2P80303 420 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CRHR2Q13324 411 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 LBX2Q6XYB7 198 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CPXCR1Q8N123 301 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PNMA3Q9UL41 463 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CA12O43570 354 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 MMP1P03956 469 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CYP2C8P10632 490 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 NLRP5P59047 1200 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TRAF1Q13077 416 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 NPY5RQ15761 445 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 MB21D1Q8N884 522 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.43■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 SMCO2A6NFE2 343 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ADAMTS3O15072 1205 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PEX10O60683 326 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 OAZ1P54368 228 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 BTBD7Q9P203 1132 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ESYT2A0FGR8 921 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ATP2A1O14983 1001 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CALML3P27482 149 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 MCTP1Q6DN14 999 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 FERMT3Q86UX7 667 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 OXER1Q8TDS5 423 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 BTBD18B2RXH4 712 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CNMDO75829 334 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ABCB11O95342 1321 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PLS1Q14651 629 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 C6orf50Q9HD87 102 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PNMA2Q9UL42 364 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 KIF28PB7ZC32 967 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 OPLAHO14841 1288 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 F13A1P00488 732 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ALAS1P13196 640 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 KRT2P35908 639 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 STAT3P40763 770 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 ADCY7P51828 1080 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 GALNT17Q6IS24 598 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 RIPK3Q9Y572 518 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TRAK2O60296 914 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 TLR2O60603 784 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 GNA11P29992 359 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 RESTQ13127 1097 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 NR5A1Q13285 461 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 BLIDQ8IZY5 108 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.39■□□□□ 0.86
CCDC78-201ENST00000293889 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 CUL5Q93034 780 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 M0R2N6 131 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 BICD2Q8TD16 824 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 CPA4Q9UI42 421 aa20.38■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 LBX1P52954 281 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 UBE2SQ16763 222 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms